陶化中学校は，戦後の学制の改革に伴い，昭和22年4月，新制中学校として発足。陶化・東和・山王の三小学校区を併せ校名を京都市立陶化中学校と称え，同年5月5日開校式を挙げた。校舎は現陶化小学校に併置された。翌23年3月31日義務教育優先の趣旨のもとに新制中学校の整理統合が行われ，これに伴う通学区域変更，独立校舎移転のため廃校。昭和23年4月伏見区深草（旧野砲隊跡）に京都市立藤森第二中学校として再発足，翌24年3月下京区東九条下殿田町に新築中の校舎落成により廃校。昭和24年4月1日校区挙げての熱烈な要望により，前記下殿田町に校舎建設，区民感激の裡に本校は創立した。校名を京都市立陶化中学校と名付けた。教職員数33名，学級数21，生徒数1016名。
校名「陶化」の由来は，平安都制による左京陶化坊の地に徳川期に九条家が邸宅を構え，陶化御殿と唱えた。この邸宅跡が大石橋付近である。校名は，陶化坊−陶化御殿から名付けられたものである。