【修学院小学校の歴史】

明治６年（１８７３）５月一乗寺尋常小学校創立（今の一乗寺集会所に１階建）
　　　　　　・学科（修身・国語・算術・体操）
　　　　　　・教員２名，児童１０８名，学級２
明治８年（１８７５）８月修学院尋常小学校創立（離宮の中の高い石垣の下に２階建）　　　　　　・学科（修身・国語・算術・体操・裁縫）
　　　　　　・教員２名，児童８７名，学級２
明治９年（１８７６）３月　　高野尋常小学校創立（上高野）
　　　　　　・教員２名，児童７５名，学級１
明治４１年（１９０８）４月　　松ヶ崎村格知小学校に併合（松ヶ崎橋西詰）
　　　　　　・松ヶ崎村と修学院村との共同
　　　　　　・一乗寺と高野に分校を設置（修学院はなくなる）
【修学院小学校の始まり】
大正５年（１９１６）
　　４月　協議のもと組合を解散し，格知小学校から修学院村立修学院尋常小学校を新設することになった。新校舎建設中のため，当分下記の４箇所に分かれて授業を行う。　
１　元格知校…修学院区の１〜４年と５・６年　
　　　　２　修学院区集会所…付設の実務女学校
　　　　３　元一乗寺分校…一乗寺区１〜４年
　　　　４　元高野分校…１〜４年
　　入学式・始業式挙行　校長（大森留二：前「格知小学校」校長）訓導（山本市太　　　　郎・北大路末吉郎・岡田八重子・小瀬勝治郎・松室とめ・田中すて・柏村　芳・　　　中西きよう）

※この年の１１月に新校舎の落成式が行われた。そのため，修学院小学校の創立記念日は，１１月２日とされているが，実際には４月から「修学院村立修学院尋常小学校」として，校長１名，先生８名で授業は進められていた。
【修学院という名はどこから…？】
　昭和６年４月京都市に編入されて，左京区修学院となるまでは，修学院村（修学寺村とも言う）・一乗寺村・上高野村と呼んでいた。叡山三千坊と言って，この周辺には多くのお寺があった。「修学院」もその中の１つで，平安時代に勝算（僧）によって開かれた。
　そのお寺は赤山禅院より西にあって，上高野に行く檜峠の南がその跡だそうです。このお寺は５００年ぐらい続きましたが，その後なくなりました。「つれづれ草」という本を書いた吉田兼好法師がしばらく住んでいたということです。

大正５年（１９１６）４月１日　　修学院村立修学院尋常小学校　入学式・始業式
４月１６日　　春季遠足　　１・２年…動物園　　３・４年…大原
　　　　　　　　　　　　　５・６年…滋賀，大津，石山　　手芸科…嵐山
４月２０日　　身体検査（仙石学校医）
５月２４日　　３年生以上大文字登山。大津でスミス氏の宙返り飛行を見る。
６月　７日　　新築校舎の上棟式。
６月２３日　　元格知小学校にいた４学級を新築校舎に移す。
７月　６日　　一乗寺と高野分校の児童を新築校舎に移す。
８月２６日　　新築校舎の受け渡し修了。
９月１５日　　修学院区集会所より手芸科教室を新築校舎に移す。
１１月２日　　新築校舎落成式挙行　
　　　　　　　　・午後，余興として展覧会・運動会・相撲を行う。
大正６年（１９１７）１月２０日　４年生以上　うさぎ狩
　　　　　　　　　　２月　２日　３年生以上　比叡山登山（雪）
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　特に大正８年は大雪。
大正９年（１９２０）　校歌ができる。（作詞：種山郁子，作曲：西川五郎）
大正１１年（１９２２）講堂の建設工事が始まる。小林正直氏の寄贈。４月に話があり，９月に工事が始まり，翌年２月９日に完成した。
昭和６年（１９３１）　京都市立尋常高等小学校という名前になる。
昭和１６年（１９４１）４月１日　京都市立修学院国民学校という名前になる。
昭和２０年（１９４５）頃　太平洋戦争で学校は，三菱重工の工場になったため，一乗寺地区（北山御坊・集会所）山端地区（聖光幼稚園・集会所）高野地区（宝童寺・三宅八幡・集会所）に分散して学習した。９月に学校に帰ってきたが，校舎は荒れ果てていた。机や教科書はなく，ノートも買えなかった。
昭和２２年（１９４７）京都市立修学院小学校という名前になる。
昭和３４年（１９５９）修学院小学校より独立して，修学院第二小学校ができる。
昭和３８年（１９６３）プールができる。
昭和５１年（１９７６）修学院小学校より独立して，上高野小学校ができる。
【音羽川の氾濫】
・昭和１０年６月２９日　前夜より降り続いた豪雨のため，高野川の橋が落ち，流失家屋４０数戸，半壊戸数４０余戸。音羽川の氾濫で，流砂が講堂に押し寄せる。高さ１mぐらい，運動場にも砂がたまり，保護者が砂のけをしてくれた。
・昭和４７年９月１６日　夕方７時頃から台風２０号による暴風雨のため，音羽川が氾濫し多量の土砂を含む鉄砲水により多大の被害を出した。死者１名，全壊家屋４戸，半壊家屋３戸，床上浸水１５５戸，床下浸水２７７戸であり，浸水家屋の多くは，約10センチ〜150センチの土砂に埋められた。修学院小学校の校舎の中も土砂で埋まった。